L'iniziativa specifica InDark ("Inflation, Dark Matter and the Large-Scale Structure of the Universe") studia la connessione tra la fisica delle particelle (e più in generale la fisica fondamentale) e il modello cosmologico standard, anche alla luce delle osservazioni cosmologiche attuali e future. Le principali attività svolte nella sezione INFN di Ferrara riguardano lo studio dell'Universo primordiale (inflazione, violazione di simmetrie fondamentali, anomalie cosmiche), della natura della materia e dell'energia oscure, delle proprietà di particelle elementari (neutrini, assioni, neutrini sterili...), di teorie alternative della gravità. Queste ricerche spesso utilizzano le osservazioni, già effettuate o attese, delle anisotropie del fondo cosmico di microonde (Planck, LiteBIRD, LSPE, Simons Observatory, S4) e della distribuzione delle strutture cosmologiche a grande scala (Euclid, DESI, SKA, WFIRST, LSST).
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